Gen anpil kalite peptides transmembrane, ak klasifikasyon yo baze sou pwopriyete fizik ak chimik, sous, mekanis enjèstyon, ak aplikasyon byomedikal.Dapre pwopriyete fizik ak chimik yo, peptides penetre manbràn yo ka divize an twa kalite: kasyonik, anfifil ak idrofob.Manbràn cationique ak amphiphilic pénétration peptides kont pou 85%, pandan y ap manbràn idrofob pénétrer peptides kont pou sèlman 15%.
1. cationique manbràn pénétrer peptide
Peptid transmembran kationik yo konpoze de peptides kout ki rich nan arjinin, lizin, ak histidine, tankou TAT, Penetratin, Polyarginine, P22N, DPV3 ak DPV6.Pami yo, arjinin gen guanidine, ki ka kosyon idwojèn ak gwoup asid fosfò chaje negatif sou manbràn selilè a ak medyatè peptides transmembrane nan manbràn nan anba kondisyon an nan valè fizyolojik PH.Etid oligarjinin (ki soti nan 3 R rive 12 R) te montre ke kapasite nan pénétration manbràn te sèlman reyalize lè kantite lajan an nan arjinin te osi ba ke 8, ak kapasite nan pénétration manbràn piti piti ogmante ak ogmantasyon nan kantite lajan an nan arjinin.Lysine, menm si kationik tankou arjinin, pa gen guanidine, kidonk lè li egziste pou kont li, efikasite pénétration manbràn li yo pa trè wo.Futaki et al.(2001) te jwenn ke bon efè pénétration manbràn ta ka reyalize sèlman lè manbràn selilè kasyonik la pénétration peptide ki genyen omwen 8 asid amine pozitivman chaje.Malgre ke rezidi asid amine ki chaje pozitivman esansyèl pou peptides pénétration antre manbràn an, lòt asid amine yo egalman enpòtan, tankou lè W14 mitasyon nan F, pénétrabilité de Penetratin pèdi.
Yon klas espesyal nan peptides transmembrane kationik se sekans lokalizasyon nikleyè (NLSs), ki gen ladann peptides kout ki rich nan arjinin, lizin ak prolin epi yo ka transpòte nan nwayo a atravè konplèks la pò nikleyè.NLS yo ka plis divize an yon sèl ak doub sezisman, ki gen ladan youn ak de grap nan asid amine debaz, respektivman.Pou egzanp, PKKKRKV soti nan viris simian 40 (SV40) se yon sèl sezisman NLS, pandan y ap pwoteyin nikleyè se yon sezisman doub NLS.KRPAATKKAGQAKKKL se sekans kout ki ka jwe yon wòl nan transmembrane manbràn.Paske pifò NLS yo gen nimewo chaj mwens pase 8, NLS yo pa efikas transmembrane peptides, men yo ka efikas transmembrane peptides lè kovalans lye nan sekans peptide idrofob yo fòme peptides transmembrane anfifil.
2. Amphiphilic transmembrane peptide
Amphiphilic transmembrane peptides konpoze de domèn idrofil ak idrofob, ki ka divize an prensipal anfifil, segondè α-helical anfifil, β-pliye anfifil ak prolin anrichi anfifil.
Prensipal kalite amphiphilic mete peptides manbràn nan de kategori, kategori ak NLSs kovalans konekte pa sekans peptide idrofob, tankou MPG (GLAFLGFLGAAGSTMGAWSQPKKKRKV) ak Pep - 1 (KETWWETWWTEWSQPKKRKV), Tou de yo baze sou siyal lokalizasyon nikleyè nan ki PKSVKKR0KV nan idrofobik, domèn nan MPG gen rapò ak sekans fizyon nan glikoprotein VIH 41 (GALFLGFLGAAGSTMG A), ak domèn nan idrofob nan Pep-1 gen rapò ak gwoup la rich triptofan ak gwo afinite manbràn (KETWWET WWTEW).Sepandan, domèn idrofob tou de yo konekte ak siyal lokalizasyon nikleyè PKKKRKV atravè WSQP.Yo te izole yon lòt klas prensipal peptides transmembran anfifil nan pwoteyin natirèl, tankou pVEC, ARF (1-22) ak BPrPr (1-28).
Segondè α-helikal anfifil transmembrane peptides yo mare nan manbràn nan atravè α-helis, ak résidus asid amine idrofil ak idrofob yo sitiye sou sifas diferan nan estrikti nan helik, tankou MAP (KLALKLALK ALKAALKLA).Pou beta peptide pliye manbràn mete anfifil, kapasite li pou fòme yon fèy pliye beta enpòtan anpil nan kapasite pénétration li nan manbràn an, tankou nan VT5 (DPKGDPKGVTVTVTVTVTGKGDPKPD) nan pwosesis pou fè rechèch sou kapasite pénétration nan manbràn nan, lè l sèvi avèk kalite D. - analogue mitasyon asid amine pa t 'kapab fòme moso beta ki plwaye, kapasite nan pénétration nan manbràn se trè pòv.Nan peptides transmembrane amphiphilic ki anrichi prolin, polyproline II (PPII) fasil fòme nan dlo pi lè proline trè rich nan estrikti polipeptid la.PPII se yon helix gòch ak 3.0 résidus asid amine pou chak vire, kòm opoze ak estrikti estanda alfa-helix dwat-men ak 3.6 résidus asid amine pou chak vire.Proline-anrichi peptides transmembrane amphiphilic enkli bovins antimicrobienne peptide 7 (Bac7), entetik polypeptide (PPR) n (n ka 3, 4, 5 ak 6), elatriye.
3. Idrofob manbràn pénétrer peptide
Peptid transmembrane idrofob gen sèlman résidus asid amine ki pa polè, ak yon chaj nèt ki mwens pase 20% nan chaj total sekans asid amine, oswa yo gen ladan yo mwatye idrofob oswa gwoup chimik ki esansyèl pou transmembran.Malgre ke peptides transmembrane selilè sa yo souvan neglije, yo egziste, tankou faktè kwasans fibroblast (K-FGF) ak faktè kwasans fibroblast 12 (F-GF12) ki soti nan sarkòm Kaposi a.
Lè poste: Mar-19-2023